本学会の目的達成のため，定款に定められた次の各事項の事業を行った。
1. 下記の研究発表会，学術講演会を開催した。（定款第5条一号）
| a) 大会： | 平成16年4月1日（木)〜5日（月），於鹿児島大学郡元キャンパス（鹿児島県鹿児島市） 大会委員長 手島新一 研究発表 口頭827題，ポスター99題 計926題 シンポジウム3件 演題38題，ミニシンポジウム2件 演題10題 平成16年度日本水産学会賞受賞者講演12件 参加者数1,349名 |
| ａ) | 「ベントス研究の漁業生物学的展開」演題12題 企画責任者：中尾 繁・五嶋聖治・大越和加・横山 壽・上野正博・林 勇夫 |
| ｂ) | 「水産物の品質・鮮度とその高度保持技術」演題14題 企画責任者：中添純一・山中英明・関 伸夫・渡邉悦生・渡部終五・福田 裕 |
| ｃ) | 「水産機能性脂質―給源・機能・利用―」演題12題 企画責任者：高橋是太郎・福永健治・柳田晃良 |
| ｄ) | 「流出油の生態系への影響と中・長期モニタリング―ナホトカ号の事例を中心に―」演題9題 （水産環境保全委員会主催） 企画責任者：大和田紘一・小山次朗・廣石伸互 |
| ａ) | 「水棲動物のリポタンパク質・ホスホリパーゼA2・レプチン受容体」演題5題 企画責任者：林 征一・飯島憲章・安藤清一 |
| ｂ) | 「頭足類学の胎動―分子解析から資源変動まで―」演題5題 企画責任者：桜井泰憲・池田 譲・滋野修一 |
| ｃ) | 「干潟域の一次生産者―その生態と機能―」演題5題 企画責任者：多田邦尚・吉松定昭 |
| ａ) | 北海道支部
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| b) | 東北支部
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| ｃ) | 関東支部
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| ｄ) | 中部支部
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| ｅ) | 近畿支部
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| ｆ) | 中国・四国支部
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| ｇ) | 九州支部
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| ａ) | 漁業懇話会委員会
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| ｂ) | 水産利用懇話会委員会
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| ｃ) | 水産増殖懇話会委員会
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| ｄ) | 水産環境保全委員会
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| ｅ) | 企画広報委員会
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| ｆ) | シンポジウム企画委員会
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| ｇ) | 第5回世界水産学会議実行委員会
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2. 下記の学会誌および学術図書を刊行した。（定款第5条二号）
1) 学会誌
| ａ) | 日本水産学会誌：第70巻2号から第71巻1号まで計6冊 ［総ページ1,109ページ｛論文79編（494ページ），短報5編（15ページ），総説13編（47ページ）， 企画広報担当記事（239ページ），その他（314ページ）｝］ 毎号4,900部発行 | |
| ｂ) | Fisheries Science：第70巻2号から第71巻1号まで計6冊 ［総ページ1,302ページ｛論文140編（1,145ページ），短報24編（72ページ），総説1編（11ページ），その他（74ページ）｝］ 毎号5,100部発行 |
2) 水産学シリーズ
| ａ) | 第140号「微量人工化学物質の生物モニタリング」竹内一郎・田辺信介・日野明徳編，1,500部発行 |
| ｂ) | 第141号「水産物の品質・鮮度とその高度保持技術」中添純一・山中英明編，1,500部発行 |
| ｃ) | 第142号「水産機能性脂質―給源・機能・利用―」高橋是太郎編，1,500部発行 |
| ｄ) | 第143号「水産食品の安全・安心対策―現状と課題―」阿部宏喜・内田直行編，1,500部発行 |
| ｅ) | 第144号「ベントス研究の漁業生物学的展開」林 勇夫・中尾 繁編，1,500部発行 |
| ｆ) | 第145号「流出油の生態系への影響と中・長期モニタリング」大和田紘一編，1,500部発行 |
3) ベルソーブックス
| ａ) | 第019号「環境ホルモンと水生生物」川合真一郎著，2,000部発行 |
| ｂ) | 第020号「エビ・カニはなぜ赤い―機能性色素カロテノイド―」松野隆男著，2,000部発行 |
| ｃ) | 第021号「水生生物の音の世界」竹村 暘著，2,000部発行 |
3. 関連学会等との連絡および協力を行った。（定款第5条三号）
1) 共催
| ａ) | 第41回理工学における同位元素・放射線研究発表会 主催 日本アイソトープ協会，共催 応用物理学会，他51学協会 平成16年7月7日〜9日，於日本青年館（東京都新宿区） |
| ｂ) | 国際会議「外来種リスクの評価と管理」 主催 横浜国立大学21世紀COEプログラム，共催 WWFジャパン，他5団体 平成16年8月26日〜29日，於横浜国立大学教育文化ホール（神奈川県横浜市） |
| ｃ) | 第29回日本動物遺伝学会議 主催 日本動物遺伝学会，共催 農林水産省，文部科学省，日本学術会議，他6学会 平成16年9月11日〜16日，於明治大学駿河台キャンパス（東京都千代田区） |
| ｄ) | 学術講演会「海とさかなと日本人」 主催 日本学術会議，後援 農林水産省，協賛 全国漁業協同組合連合会 平成17年3月5日，於日本学術会議講堂（東京都港区） |
2) 協賛
| a) | 第33回海中海底工学フォーラム 主催 海中海底工学フォーラム運営委員会，協賛 日本造船学会，他6団体 平成16年5月10日，於東京大学大学院数理科学研究科大講義室（東京都目黒区） |
| b) | 第15回食品ハイドロコロイドシンポジウム 主催 食品ハイドロコロイド研究会，協賛 化学工学会，他24学協会 平成16年5月28日，於東京DICビル大会議室（東京都中央区） |
| c) | 食品，医薬品におけるアモルファス（非晶質）科学の応用と発展 主催 低温生物工学会，協賛 日本熱測定学会，他12学会 平成16年6月5日，於東京海洋大学品川キャンパス |
| d) | 第7回マリンバイオテクノロジー学会大会 主催 マリンバイオテクノロジー学会，協賛 日本農芸化学会，他12学協会 平成16年6月17日〜19日，於北海道大学学術交流会館，クラーク会館（北海道札幌市） |
| e) | 平成16年度農学系JABEE研修会 主催 (財)農学会，他3学会，協賛 砂防学会，他29学協会 平成16年7月31日・8月1日，於東京大学農学部弥生講堂 |
| f) | 第12回IIFET国際漁業経済会議 主催 国際漁業研究会，協賛 日本鰹鮪漁業協同組合連合会，他関係団体 平成16年8月5日・6日，於東京海洋大学品川キャンパス |
| g) | 第18回キチン・キトサンシンポジウム 主催 キチン・キトサン学会，協賛 日本栄養・食糧学会，他11学会 平成16年8月5日・6日，於成蹊大学（東京都武蔵野市） |
| h) | シンポジウム「日本の水産学研究の現状と課題（水産学一般）」 主催 広島大学大学院生物圏科学研究科，協賛 日本魚病学会 平成16年8月28日，於広島大学サタケメモリアルホール（広島県東広島市） |
| i) | 第2回高付加価値食品開発のためのフォーラム 主催 日本食品機械研究会，協賛 日本栄養・食糧学会，他13学会 平成16年9月17日・18日，於富士教育研究所（静岡県裾野市） |
| j) | 第45回高圧討論会 主催 日本高圧力学会，協賛 応用物理学会，他45学協会 平成16年10月9日〜11日，於立命館大学びわこ・くさつキャンパス（滋賀県草津市） |
| k) | 第34回海中海底工学フォーラム 主催 海中海底工学フォーラム運営委員会，協賛 日本造船学会，他7団体 平成16年10月18日，於東京大学海洋研究所講堂（東京都中野区） |
| l) | フグ・ゲノミクス―研究の現状と展望 主催 フグ・ゲノミクス国際シンポジウム実行委員会，協賛 水産庁，他1学会 平成16年11月3日〜6日，於東京大学農学部弥生講堂 |
| m) | OCEANS '04 MTS/IEEE/TECHNO-OCEAN '04 主催 テクノオーシャン，協賛 日本水環境学会，他多団体 平成16年11月9日〜12日，於神戸国際展示場（兵庫県神戸市） |
| n) | 第4回基準油脂分析試験法セミナー 主催 日本油化学会規格試験法委員会，協賛 日本化学会，他8学会 平成16年11月11日・12日，於東京理科大学森戸記念館第1フォーラム（東京都新宿区） |
| o) | 海洋調査技術学会第16回研究成果発表会 主催 海洋調査技術学会，協賛 海中海底工学フォーラム，他13学協会 平成16年11月18日・19日，於海上保安庁海洋情報部（東京都中央区） |
| p) | シンポジウム「人とフジツボとのかかわり」 主催 日本付着生物学会，協賛 日本学術会議水産学研究連絡委員会，他21団体 平成16年11月18日・19日，於日本科学未来館（東京都江東区） |
| q) | EFAFF2004（第5回農林水産環境展） 主催 農林水産環境展実行委員会，協賛 国際食糧農業協会，他64団体 平成16年11月24日〜26日，於日本コンベンションセンター（千葉県千葉市） |
| r) | 国際シンポジウム「コイヘルペスウイルス感染症の現状と防疫対策」 主催 東京海洋大学，(独)水産総合研究センター，協賛 日本水産学会，他1学会 平成16年12月15日，於東京海洋大学品川キャンパス |
| s) | 第18回海洋工学シンポジウム 主催 日本造船学会，協賛 海洋音響学会，他28学協会 平成17年1月27日・28日，於東京海洋大学越中島キャンパス（東京都江東区） |
3) 後援
| a) | 第29回国際動物遺伝学会議 主催 日本動物遺伝育種学会，後援 農林水産省，他8団体 平成16年9月11日〜16日，於明治大学駿河台キャンパス（東京都千代田区） |
| b) | 水資源学シンポジウム「国連水の日―気候変動がもたらす水問題―」 主催 日本学術会議水資源専門委員会，他2団体，後援 IWRA国際水資源学会日本国内委員会， 他13学協会 平成17年3月23日，於日本学術会議講堂 |
4) 日本学術会議への協力
5) 日本農学会への協力
6) (財)農学会への協力
7) 学術の共同研究，情報の交換
8) 海外との学術交流
| a) | アメリカ水産学会との交流 (1) アメリカ水産学会大会出席 (2) 日本水産学会大会招待 |
| b) | 第4回世界水産学会議参加 |
| c) | 文献交換の斡旋 (1) 日本国内情報の照会に対する回答 (2) その他 |
| d) | 外国人研究者との交流 |
| e) | その他 |
4. 下記の研究業績の表彰を行った。（定款第5条四号）
1) 日本水産学会賞受賞者の決定
| a) | 功績賞 | 水産一般 | 坂本 亘 | バイオテレメトリーによる海洋生物行動に関する研究 |
| 梨本勝昭 | 漁獲機構と選択性に関する一連の研究 | |||
| 水産化学 | 関 伸夫 | 水産食品のタンパク質に関する一連の研究 | ||
| b) | 進歩賞 | 水産一般 | 上田 宏 | サケ科魚類の母川回帰機構に関する生理・生態学的研究 |
| 岡本信明 | 魚類のウイルス抵抗性形質に関する分子育種学的研究 | |||
| 水産化学 | 加納 哲 | 魚類筋肉タンパク質の構造安定性に関する生化学的研究 | ||
| c) | 奨励賞 | 水産一般 | 小路 淳 | サワラ仔稚魚の摂餌戦略と資源加入機構に関する研究 |
| 深田陽久 | サケ科魚類成長ホルモンの作用に関する研究 | |||
| 山口敦子 | 板鰓類の資源生物学的研究 | |||
| 水産化学 | 濱田友貴 | 魚貝類アレルゲンに関する食品化学的研究 | ||
| 米田千恵 | 貝類筋肉のテクスチャーに関する生化学的および調理科学的研究 | |||
| d) | 田内賞 | 稲田博史 | イカ釣り漁業における漁獲技術に関する研究 | |
| e) | 技術賞 | 水産一般 | 岡本峰雄 | 海中計測技術に関する研究 |
| 平田 靖 | マガキの人工採苗技術開発に関する研究 | |||
| 水産化学 | 該当なし |
2) 日本水産学会論文賞の決定
| a) | Fisheries Science第70巻1号123-131ページ Numerical investigation of the optimal control rule for decision-making in fisheries management 勝川俊雄 |
| b) | Fisheries Science第70巻3号456-462ページ Mass preparation of marine silage from Undaria pinnatifida and its dietary effect for young pearl oysters 内田基晴，故 沼口勝之，村田昌一 |
| c) | Fisheries Science第70巻4号620-628ページ Isolation of microsatellite markers by in silico screening implicated for genetic linkage mapping in Japanese pufferfish Takifugu rubripes 古川聡史，武島弘彦，大高太郎，三星 亨，白須邦夫，池田大介，金子 元，西田 睦，渡部終五 |
| d) | Fisheries Science第70巻4号629-637ページ Sequence and polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis of the large subunit rRNA gene of bivalve: Simple and widely applicable technique for multiple species identification of bivalve larva 細井公富，田辺(細井)祥子，澤田英樹，上野正博，豊原治彦，林 勇夫 |
| e) | Fisheries Science第70巻4号638-644ページ Daily change of genetic variability in hatchery offspring of red sea bream during spawning season Estu Nugrohoa，谷口順彦 |
| f) | Fisheries Science第70巻4号645-649ページ Transgenic medaka with brilliant fluorescence in skeletal muscle under normal light 木下政人 |
| g) | 日本水産学会誌第70巻5号728-737ページ 逸失底刺網のゴーストフィッシング能力の経時的変化と死亡数推定 仲島淑子，松岡達郎 |
| h) | 日本水産学会誌第70巻6号910-921ページ 鹿児島湾におけるヒラメ人工種苗の放流効果 厚地 伸，増田育司 |
3) 平成17年度日本農学賞受賞候補者の推薦
4) (財)農学会日本農学進歩賞の推薦
5. その他目的を達成するために必要な事業を行った。（定款第5条五号）
下記の会議を開催した。
| 1) | 通常総会1回，平成16年4月3日，於鹿児島大学郡元キャンパス
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| 2) | 評議員会1回，平成17年3月31日，於東京海洋大学品川キャンパス
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| 3) | 理事会7回
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| 4) | 編集委員会 | 5回 |
| 5) | 企画広報委員会 | 6回 |
| 6) | 学会賞選考委員会 | 3回 |
| 7) | シンポジウム企画委員会 | 2回 |
| シンポジウム企画小委員会（特別委員会） | 2回 | |
| 8) | 出版委員会 | |
| 水産学シリーズ担当 | 2回 | |
| ベルソーブックス担当 | 2回 | |
| 9) | 漁業懇話会委員会 | 1回 |
| 10) | 水産利用懇話会委員会 | 3回 |
| 11) | 水産増殖懇話会委員会 | 3回 |
| 12) | 水産環境保全委員会 | 2回 |
| 13) | 選挙管理委員会 | 3回 |
| 14) | 水産学教育推進委員会 | 5回 |
| 15) | 北海道支部 | 支部総会1回，支部評議員会2回 |
| 16) | 東北支部 | 支部総会1回，支部評議員会2回，支部幹事会1回，評議員・幹事合同会議1回 |
| 17) | 関東支部 | 支部評議員会1回 |
| 18) | 中部支部 | 支部総会1回，支部評議員会2回 |
| 19) | 近畿支部 | 支部総会1回，支部評議員会2回 |
| 20) | 中国・四国支部 | 支部総会1回，支部評議員会3回 |
| 21) | 九州支部 | 支部総会1回，支部評議員会3回 |
| 22) | 第5回世界水産学会議実行委員会等 | 3回 |